En el año 1996, el Consejo de Directores segrega la Facultad de Ciencias Naturales, Médicas y Tecnológicas, crea la Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud, con las Escuelas de Medicina y de Ciencias de la Salud, designando como Decano al Dr. José Antonio Lara, con especialidad en Cirugía General.
Luego en el año 1997 se abrió la Extensión de la Escuela de Medicina en la Sede Regional de David, Provincia de Chiriquí bajo la Dirección del Dr. Carlos Camilo Caballero Araúz, médico especialista en Medicina Familiar.
En el mes de enero de 2018 el Consejo de Directores aprobó la apertura de la Extensión de la Escuela de Medicina en la Sede Regional de Santiago, Provincia de Veraguas bajo la Dirección del Dr. Roberto Restrepo Pinilla, médico especialista en Medicina y Rehabilitación.
Desde sus inicios, la carrera de Doctor en Medicina y Cirugía en Columbus University ha estado enfocada en brindar una educación integral que combine la teoría con la práctica clínica. El plan de estudios se ha diseñado cuidadosamente para proporcionar a los estudiantes los conocimientos, habilidades y destrezas necesarias para ejercer la medicina de manera ética y competente.
La Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud cuenta con un cuerpo docente altamente calificado, integrado por profesionales de la medicina y otras disciplinas con amplia experiencia clínica y académica. La primera Graduación de médicos se realizó el 27 de diciembre de 1999. Por más de 30 años hemos entregado a la sociedad 1,132 nuevos profesionales de la medicina competentes para enfrentar los desafíos de la práctica médica contemporánea.